冷库的鼠害会造成巨大的经济损失，它不仅咬食肉品，污染食品，且能传播疫病，破坏冷库的隔热结构，损坏建筑设施。由于被老鼠咬破电线而引起冷库火灾的报道也时有耳闻。故应经常检查，发现鼠害立即采取灭鼠措施。
鼠类由周围环境潜入冷库，有时与食品一同进入，因此应设法使冷库周围地区没有老鼠。在接收物品时，应仔细检查，特别是带有外包装的食品，更应仔细检查，以免把鼠类带进冷库内。目前，冷库内常用的灭鼠方法有器械捕鼠、化学药物灭鼠和CO2气体灭鼠。
（1）器械捕鼠用鼠夹或用电子捕鼠仪器。有一种电子捕鼠器，是用220V电压为电源，有三根输出电线，经电子设备产生可控制1500V电压，三根单线各能延长1000m,分别安置三个方向，可以同时捕鼠。老鼠接触后即毙，同时发出命中信号，命中率100%。
（2）化学药物灭鼠效果较好的是敌鼠钠盐灭鼠。敌鼠钠盐的配方是先将药物用开水溶化成5%溶液，然后按0.025%~0.05%浓度与食饵混匀即成。此外，国外还介绍一种广谱灭鼠剂“Vacor”,老鼠吃进少量后8h内就死亡，而其他动物、鸟类误食后无毒。
（3）CO2气体灭鼠因CO2无毒，在使用时不用搬开食品，但对操作人员有窒息作用，因此操作时人员要带上O2呼吸器。CO2灭鼠，不但无毒，而且效果显著。做法是：1m3的库房空间用浓度25%的CO20.7kg，或用浓度35%的CO20.5kg,紧闭库门24h即可达到彻底灭鼠的目的。同时CO2 也具有灭菌的性能，库内温度和食品的堆放皆不需要改变，省时省力。
